报告时间:11月22日(星期日)9:00
报告形式:腾讯会议(会议ID:170 156 944,密码:202022)
报 告 人:邓明华,北京大学教授
报告题目:基于深度学习的单细胞聚类与标注
内容简介:本报告将介绍本课题组近期开发的几个深度学习生物信息应用。单细胞RNA-Seq技术现在成为了生物学研究的基本手段,但其高噪声和稀疏性为数据分析带来了挑战。细胞聚类和细胞标注是单细胞测序数据分析的最基本内容,我们融合聚类和基于深度学习的非线性降维方法,开发了聚类方法sciDesk;进一步结合对比学习的思想,我们开发了细胞标注方法scAnCluster, 模拟数据和实际数据分析表明了算法的有效性。
报告人简介:邓明华,北京大学数学科学学院教授。1987年9月-1998年1月在北京大学数学学院学习,毕业后留校工作至今。2003年8月晋升为副教授,2006年任博士生导师,2009年8月晋升为教授。其间2001年2月-2003年8月在美国南加州大学计算分子生物学中心从事博士后研究工作,2009年8月-2010年1月美国耶鲁大学访问副教授。目前,发表SCI论文80余篇。曾先后主持5项自然科学基金面上项目和1项863项目,参加3项973项目、1项科技部重点研发项目、1项基金委创新团队项目和1项海外合作项目。